Estudio multicéntrico argentino sobre la utilidad del panel de neumonía de FilmArray® / Argentine multicenter study on the utility of the FilmArray® pneumonia panel

Resumen Las infecciones de las vías respiratorias inferiores se encuentran entre aquellas en las que el uso inadecuado de antimicrobianos es frecuente, por lo que es fundamental contar con una prueba diagnóstica rápida, sensible y específica. El sistema de FilmArray es un análisis de PCR múltiple con un panel de neumonía que incluye 26 microorganismos y 7 marcadores de resistencia antimicrobiana. Los objetivos de este estudio fueron: a) establecer la correlación entre los cultivos cuantitativos para agentes bacterianos de muestras de vías respiratorias inferiores (MRVB) y la detección fenotípica de mecanismos de resistencia con los correspondientes resultados de FilmArray; b) determinar el cambio terapéutico generado con el informe del resultado inmediato. Se incluyó un total de 194 MRVB correspondientes a 191 pacientes con neumonía y se documentaron 277 bacterias. FilmArray identificó 253/277 (91%) bacterias y 161/277 (58%) se aislaron del cultivo, 58 (23%) coincidieron con el mismo recuento, 116 (46,7%) dieron mayores recuentos con FilmArray y 72 (28,9%) fueron detectadas por este método pero el cultivo fue negativo. Se detectaron marcadores de resistencia antimicrobiana en 63 aislados, pero solo 28 fueron confirmados por métodos fenotípicos. Estos resultados podrían haber provocado cambios en el tratamiento antibiótico en el 74,6% (174/194). FilmArray es una herramienta útil para optimizar el tratamiento antimicrobiano en pacientes con neumonía.

Abstract Lower respiratory tract infections are among those in which the inappropriate use of antimicrobials is common, so it is essential to have a rapid, sensitive and specific diagnostic test. The FilmArray system is a multiplex PCR assay with a pneumonia panel that includes 26 microorganisms and 7 antibiotic resistance markers. The objectives of this study were: a) to establish the correlation between quantitative cultures for bacterial agents from lower respiratory tract samples (MRVB) and the phenotypic detection of resistance mechanisms with the corresponding results of FilmArray b) to determine the therapeutic change generated with the immediate result report. A total of 194 MRVB corresponding to 191 patients with pneumonia were included and 277 bacterial strains were documented. FilmArray identified 253/277 (91%) bacteria and 161/277 (58%) were isolated from culture, 58 (23%) matched the same count, 116 (46.7%) yielded higher counts with FilmArray, and 72 (28.9%) with negative culture were detected by this method. Antibiotic resistance markers were detected in 63 strains, but only 28 were confirmed by phenotypic methods. These results may cause changes in the antimicrobial treatment in 74.6% (174/194). FilmArray is a useful tool to optimize antimicrobial therapy in patients with pneumonia.

Resumo As infecções do trato respiratório inferior estão entre aquelas em que o uso inadequado de antimicrobianos é comum, por isso é essencial um teste diagnóstico rápido, sensível e específico. O sistema FilmArray é um ensaio de PCR multiplo com um painel de pneumonia que inclui 26 microrganismos e 7 marcadores de resistência antimicrobiana. Os objetivos deste estudo foram: a) estabelecer a correlação entre as culturas quantitativas de agentes bacterianos de amostras do trato respiratório inferior (MRVB) e a detecção fenotípica de mecanismos de resistência com os resultados correspondentes do FilmArray b) determinar a alteração terapêutica gerada com o relatório de resultado imediato. Um total de 194 MRVB correspondendo a 191 pacientes com pneumonia foram incluídos e 277 cepas bacterianas foram documentadas. FilmArray identificou 253/277 (91%) bactérias e 161/277 (58%) foram isoladas da cultura, 58 (23%) coincidiram com mesma contagem, 116 (46,7%) deram contagens mais altas com FilmArray e 72 (28,9%) foram detectados por este método, mas a cultura foi negativa. Marcadores de resistência antimicrobiana foram detectados em 63 cepas, mas apenas 28 foram confirmados por métodos fenotípicos. Esses resultados puderam causar alterações no tratamento antibiótico em 74,6% (174/194). FilmArray é uma ferramenta útil para otimizar a terapia antimicrobiana em pacientes com pneumonia..

Controversias durante la pandemia de COVID-19 / Controversies during the COVID-19 pandemic

Resumen La pandemia COVID-19 produjo un impacto en la salud pública y la economía mundial. El objetivo de este documento fue actualizar según la evidencia disponible, el manejo de algunos elementos básicos en los Programas de Control de Infecciones (PCI) y la atención diaria de los pacientes. Como resultado: 1. No se recomienda el uso rutinario de barbijo N95 para la atención de pacientes sospechosos o confirmados de COVID-19. Datos disponibles indican que el SARS-CoV-2 se ha propagado principalmente a través de la transmisión por gotas y contacto. En ciertas situaciones se describen contagios de persona a persona a través de la vía respiratoria aérea observadas en ambientes poco ventilados, y mientras el individuo realizaba acciones de mayor potencialidad de transmisión. 2. Se acepta el reúso limitado y métodos de decontaminación de máscaras/ barbijos N95 bajo protocolos seguros y eficaces en el contexto de recursos limitados. 3. Se puede levantar el aislamiento de pacientes confirmados de COVID-19 bajo una estrategia basada en la clínica, factores de riesgo individuales y tiempo de evolución de la enfermedad. 4. No se requiere PCR control en casos confirmados para determinar el alta epidemiológica. 5. La evidencia actual demuestra que existe la posibilidad de reinfección, aunque su diagnóstico es dificultoso. 6. La medición de anticuerpos tiene un rol específico en estudios de prevalencia, diagnóstico de síndrome inflamatorio multisistémico y cuadro compatible con PCR negativa después del 7° día.

Abstract The COVID-19 pandemic has had an impact on public health and the global economy. The objective of this document was to update, according to the available evidence, the management of some basic elements in the Infection Control Programs (PCI) and the daily care of patients. As a result: 1. The routine use of the N95 masks is not recommended for the care of suspected or confirmed COVID-19 patients. Available data indicates that SARS-CoV-2 has spread primarily like most other common respiratory viruses, through droplet and contact transmission. In certain situations, person-to-person transmission is described through the airway, observed in poorly ventilated environments, and while the individual carried out actions of greater potential transmission 2. The limited reuse and decontamination methods of N95 masks are accepted under safe and effective prot ocols in the context of limited resources. 3. The isolation of patients with COVID-19 can be lifted under a strategy based on the clinic, individual risk factors and time of evolution of the disease. 4. PCR control is not required in confirmed cases to determine epidemiological discharge. 5. Current evidence shows that there is a possibility of reinfection although its diagnosis is difficult. 6. The measurement of antibodies has a specific role in prevalence studies, diagnosis of multisystemic inflammatory syndrome and a picture compatible with negative PCR after the 7th. day.

[Controversies during the COVID-19 pandemic]. / Controversias durante la pandemia de COVID-19.

The COVID-19 pandemic has had an impact on public health and the global economy. The objective of this document was to update, according to the available evidence, the management of some basic elements in the Infection Control Programs (PCI) and the daily care of patients. As a result: 1. The routine use of the N95 masks is not recommended for the care of suspected or confirmed COVID-19 patients. Available data indicates that SARS-CoV-2 has spread primarily like most other common respiratory viruses, through droplet and contact transmission. In certain situations, personto-person transmission is described through the airway, observed in poorly ventilated environments, and while the individual carried out actions of greater potential transmission 2. The limited reuse and decontamination methods of N95 masks are accepted under safe and effective prot ocols in the context of limited resources. 3. The isolation of patients with COVID-19 can be lifted under a strategy based on the clinic, individual risk factors and time of evolution of the disease. 4. PCR control is not required in confirmed cases to determine epidemiological discharge. 5. Current evidence shows that there is a possibility of reinfection although its diagnosis is difficult. 6. The measurement of antibodies has a specific role in prevalence studies, diagnosis of multisystemic inflammatory syndrome and a picture compatible with negative PCR after the 7th. day.

La pandemia COVID-19 produjo un impacto en la salud pública y la economía mundial. El objetivo de este documento fue actualizar según la evidencia disponible, el manejo de algunos elementos básicos en los Programas de Control de Infecciones (PCI) y la atención diaria de los pacientes. Como resultado: 1. No se recomienda el uso rutinario de barbijo N95 para la atención de pacientes sospechosos o confirmados de COVID-19. Datos disponibles indican que el SARS-CoV-2 se ha propagado principalmente a través de la transmisión por gotas y contacto. En ciertas situaciones se describen contagios de persona a persona a través de la vía respiratoria aérea observadas en ambientes poco ventilados, y mientras el individuo realizaba acciones de mayor potencialidad de transmisión. 2. Se acepta el reúso limitado y métodos de decontaminación de máscaras/barbijos N95 bajo protocolos seguros y eficaces en el contexto de recursos limitados. 3. Se puede levantar el aislamiento de pacientes confirmados de COVID-19 bajo una estrategia basada en la clínica, factores de riesgo individuales y tiempo de evolución de la enfermedad. 4. No se requiere PCR control en casos confirmados para determinar el alta epidemiológica. 5. La evidencia actual demuestra que existe la posibilidad de reinfección, aunque su diagnóstico es dificultoso. 6. La medición de anticuerpos tiene un rol específico en estudios de prevalencia, diagnóstico de síndrome inflamatorio multisistémico y cuadro compatible con PCR negativa después del 7° día.

Histoplasmosis en el sistema nervioso central en una paciente pediátrica inmunocompetente / Central nervous system histoplasmosis in an immunocompetent pediatric patient

La histoplasmosis en el sistema nervioso central es una enfermedad poco frecuente, con mayor prevalencia en pacientes inmunosuprimidos, secundaria a enfermedad diseminada (5%-10%), con una alta tasa de mortalidad en caso de demorarse el diagnóstico y su tratamiento. Presentamos a una niña de 12 años previamente sana, que desarrolló meningoencefalitis por Histoplasma capsulatum sin evidencia de enfermedad generalizada. La paciente era oriunda de una región infestada por murciélagos de Tucumán, República Argentina, y desarrolló, durante 18 meses previos a su internación, cefalea y síndrome febril. Las imágenes del sistema nervioso central mostraron meningoencefalitis, que sugirió tuberculosis. Recibió tratamiento antibiótico y tuberculostático, sin mejoría. Luego recibió anfotericina B liposomal durante 6 semanas. Neurológicamente, mejoró de manera considerable. Por último, el cultivo de líquido cefalorraquídeo permitió aislar Histoplasma capsulatum. Se discuten las dificultades diagnósticas y el tratamiento de neurohistoplasmosis en pacientes inmunocompetentes, como también se intenta alertar acerca de la presencia de una cepa de Histoplasma capsulatum con afinidad por el sistema nervioso central.

Neurohistoplasmosis is a rare disease, most prevalent in immunosuppressed patients, secondary to disseminated disease with a high mortality rate when diagnosis and treatment are delayed. We report a previously healthy 12 year old girl, from a bat infested region of Tucuman Province, Argentine Republic, who developed meningoencephalitis due to Histoplasma capsulatum. Eighteen months prior to admission the patient started with headaches and intermittent fever. The images of the central nervous system showed meningoencephalitis suggestive of tuberculosis. She received antibiotics and tuberculostatic medications without improvement. Liposomal amphotericin B was administered for six weeks. The patient's clinical status improved remarkably. Finally the culture of cerebral spinal fluid was positive for micelial form of Histoplasma capsulatum. The difficulties surrounding the diagnosis and treatment of neurohistoplasmosis in immunocompetent patients are discussed in this manuscript, as it also intends to alert to the presence of a strain of Histoplasma capsulatum with affinity for the central nervous system.

Central nervous system histoplasmosis in an immunocompetent pediatric patient. / Histoplasmosis en el sistema nervioso central en una paciente pediátrica inmunocompetente.

Neurohistoplasmosis is a rare disease, most prevalent in immunosuppressed patients, secondary to disseminated disease with a high mortality rate when diagnosis and treatment are delayed. We report a previously healthy 12 year old girl, from a bat infested region of Tucuman Province, Argentine Republic, who developed meningoencephalitis due to Histoplasma capsulatum. Eighteen months prior to admission the patient started with headaches and intermittent fever. The images of the central nervous system showed meningoencephalitis suggestive of tuberculosis. She received antibiotics and tuberculostatic medications without improvement. Liposomal amphotericin B was administered for six weeks. The patient's clinical status improved remarkably. Finally the culture of cerebral spinal fluid was positive for micelial form of Histoplasma capsulatum. The difficulties surrounding the diagnosis and treatment of neurohistoplasmosis in immunocompetent patients are discussed in this manuscript, as it also intends to alert to the presence of a strain of Histoplasma capsulatum with affinity for the central nervous system.

La histoplasmosis en el sistema nervioso central es una enfermedad poco frecuente, con mayor prevalencia en pacientes inmunosuprimidos, secundaria a enfermedad diseminada (5%-10%), con una alta tasa de mortalidad en caso de demorarse el diagnóstico y su tratamiento. Presentamos a una niña de 12 años previamente sana, que desarrolló meningoencefalitis por Histoplasma capsulatum sin evidencia de enfermedad generalizada. La paciente era oriunda de una región infestada por murciélagos de Tucumán, República Argentina, y desarrolló, durante 18 meses previos a su internación, cefalea y síndrome febril. Las imágenes del sistema nervioso central mostraron meningoencefalitis, que sugirió tuberculosis. Recibió tratamiento antibiótico y tuberculostático, sin mejoría. Luego recibió anfotericina B liposomal durante 6 semanas. Neurológicamente, mejoró de manera considerable. Por último, el cultivo de líquido cefalorraquídeo permitió aislar Histoplasma capsulatum. Se discuten las dificultades diagnósticas y el tratamiento de neurohistoplasmosis en pacientes inmunocompetentes, como también se intenta alertar acerca de la presencia de una cepa de Histoplasma capsulatum con afinidad por el sistema nervioso central.

Implementation of a Ventilator-Associated Pneumonia Prevention Bundle in a Single PICU.

OBJECTIVE: Ventilator-associated pneumonia is considered the second most frequent infection in pediatric intensive care, and there is agreement on its association with higher morbidity and increased healthcare costs. The goal of this study was to apply a bundle for ventilator-associated pneumonia prevention as a process for quality improvement in the PICU of Hospital Italiano de Buenos Aires, Argentina, aiming to decrease baseline ventilator-associated pneumonia rate by 25% every 6 months over a period of 2 years. DESIGN: Quasi-experimental uninterrupted time series. SETTING: PICU of Hospital Italiano de Buenos Aires, Argentina. PATIENTS: All mechanical ventilated patients admitted to the unit. INTERVENTION: It consisted of the implementation of an evidence-based ventilator-associated pneumonia prevention bundle adapted to our unit and using the plan-do-study-act cycle as a strategy for quality improvement. The bundle consisted of four main components: head of the bed raised more than 30°, oral hygiene with chlorhexidine, a clean and dry ventilator circuit, and daily interruption of sedation. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: Ventilator-associated pneumonia prevention team meetings started in March 2012, and the ventilator-associated pneumonia bundle was implemented in November 2012 after it had been developed and made operational. Baseline ventilator-associated pneumonia rate for the 2 years before intervention was 6.3 episodes every 1,000 mechanical ventilation days. ventilator-associated pneumonia rate evolution by semester and during the 2 years was, respectively, 5.7, 3.2, 1.8, and 0.0 episodes every 1,000 mechanical ventilation days. Monthly ventilator-associated pneumonia rate time series summarized in a 51-point control chart showed the presence of special cause variability after intervention was implemented. CONCLUSIONS: The implementation over 2 years of a ventilator-associated pneumonia prevention bundle specifically adapted to our unit using quality improvement tools was associated with a reduction in ventilator-associated pneumonia rate of 25% every 6 months and a nil rate in the last semester.